Torres introduce en la música religiosa las nuevas ideas del impresionismo francés trasladados a una estética más cercana al nacionalismo español. Sus obras más conocidas son sus Saetas, una colección de piezas para órgano basadas en formas populares andaluzas.
Toda su amplia producción para órgano fue publicada bajo el título El organista español, convirtiéndose en precursor del espíritu nacionalista que secundaron más tarde Turina y Falla. En cuanto a sus obras religiosas, las más famosas son sus Motetes al Sagrado Corazón de Jesús y su obra Ofertorio y plegaria.
También compuso varias zarzuelas bajo el seudónimo de Matheu y un pasodoble, titulado, Joseíto de Málaga.